广州中医药大学办学基础为创立于1924年的广东中医药专门学校。1956年经国务院批准成立广州中医学院，是新中国首批四所高等中医药本科院校之一，1995年更名为广州中医药大学。原直属国家卫生部，2000年转由广东省人民政府管理。2017年入选国家“双一流”学科建设高校，2018年晋级广东省高水平大学重点建设高校。

广州中医药大学现一共有附属医院30所，分别为第一附属医院、第二附属医院、第三附属医院和附属粤海医院、附属深圳中医院、附属中山中医院、附属广州中医院、附属佛山中医院、附属广东第二中医院、附属南海妇产儿童医院、附属茂名中医院、附属湛江第一中医院、附属广州中西医结合医院、附属新会中医院。

附属台山中医院、附属湛江第二中医院、附属广东中西医结合医院、附属顺德中医院、附属汕头中医院、附属海南中医院、附属重庆北碚中医院、附属清远中医院、附属三亚中医院、附属宝安中医院、附属陕西安康中医院、附属海口中医院、附属深圳平乐骨伤科医院、附属内蒙古国际蒙医医院、附属内蒙古中医院和附属东莞中医院。

其中附属东莞中医院为广州中医药大学新晋附属医院，2020年7月25日，在东莞市中医院举行广州中医药大学与东莞市人民政府合作共建广州中医药大学东莞医院签约及揭牌仪式。省中医药局、东莞市政府和广中医等领导出席签约和揭牌仪式。

广州中医药大学东莞医院是广州中医药大学与地市政府合作共建的第四所医院。根据合作协议，东莞市中医院将参照广州中医药大学直属附属医院的标准运营和管理。未来，医院将以“广州中医药大学东莞医院”为第一名称，保留“东莞市中医院”的名称及建制。

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